Kada se pojavi nova bolest, znanstvenici širom svijeta poduzimaju mjere kako bi shvatili što mogu učiniti s njom, nadajući se da će pronaći nove načine za pomoć.
Istraživači sa Univerziteta u Minnesoti (UM) učinili su upravo to – istražujući strukturu proteina 'spike' na površini SARS-CoV-2, tim se nada da su doprinijeli osnovi za razvoj novog lijeka.
“Generalno proučavajući koje su strukturne karakteristike virusnih proteina najvažnije za uspostavljanje kontakta s ljudskim ćelijama”, objašnjava biomedicinski istraživač Fang Li, “možemo razviti lijekove koji ih traže i blokiraju njihovu aktivnost.”
Tim je rendgenskom kristalografijom stvorio 3D model kako izgleda šiljasti protein i kako se veže za ljudske ćelije.
Iako ovo ne zvuči kao fotografije koronavirusa koje ste navikli vidjeti, nevjerovatno je koristan model za biologe. Omogućava im da vizualiziraju kako male mutacije u proteinu stvaraju razne nabore i grebene koji omogućavaju da se virusne čestice prikače na receptore u našim vlastitim ćelijama.
Istraživači su otkrili da soj koronavirusa SARS-CoV-2 ima nekoliko mutacija koje čine posebno kompaktni „češalj“ u proteinu klasja.
Ovaj je greben kompaktniji od virusa SARS i možda je jedan od razloga što ovaj novi soj toliko vješto zaražava ljude, što uzrokuje COVID-19.
'3D struktura to pokazuje u odnosu na virus koji je izazvao izbijanje SARS-a u 2002-2003. Novi koronavirus razvio je nove strategije vezanja za svoj ljudski receptor, što je rezultiralo čvrstim vezivanjem ', rekao je Lee.
“Čvrsto vezivanje za ljudski receptor može pomoći virusu da zarazi ljudske stanice i širi se među ljudima.”
Tim se nada da će nova simulacija pomoći drugim istraživačima u razvoju lijekova ili vakcina protiv virusa.
“Naš rad može pomoći u razvoju monoklonskih antitijela koja djeluju kao lijek za prepoznavanje i neutralizaciju dijela proteina klasova koji veže receptor”, rekao je Lee.
“Ili bi neki od proteina trna mogao biti osnova vakcine.”
Ali u ovoj fazi moramo biti oprezni. Ova vrsta istraživanja se neprestano razvija, a iako model obećava, u studiji su korišteni samo mali fragmenti virusa – njegova vezana domena – i stoga, još informacija treba proučiti.
Studija je objavljena u časopisu Nature.
Izvori: Fotografija: (Shang et al., Nature, 2020)