Možda ste čuli za Folding @ home, popularnu aplikaciju koja se može pokrenuti na računaru kako bi istraživačima pomogla da se nose sa nekim medicinskim problemima, uključujući novi koronavirus.
U proteklih mjesec dana mreža dobrovoljaca koji su je instalirali toliko se razvila da platforma nadmašuje najsnažnija svjetska superračunala.
Prema direktoru i biokemičaru Folding @ home Gregu Bowmanu, skoro 700 000 novih operatora Folding @ home pridružilo se posljednjih sedmica. Ovo je ogroman porast u odnosu na 30.000 ljudi koji stalno koriste Folding @ home.
A to takođe čini veliku razliku u računarskoj snazi - mreža Folding @ home je početkom ove nedelje dostigla zapanjujućih 2,4 eksaflopa računarske snage, čineći je bržom od 500 najboljih računara na svetu zajedno.
Glavni zadatak Folding @ home-a je modeliranje ponašanja proteina u tijelu, što je u osnovi mnogih osnovnih bioloških funkcija.
Te funkcije uključuju virusnu infekciju: tim Folding @ home posebno proučava kako se takozvani 'klas' virusa SARS-CoV-2 (koji se zapravo sastoji od tri proteina) veže za ljudske stanice i zarazi ljudsko tijelo.
Ovo je ključni način da novi koronavirus uđe u ljudsko tkivo, pa bi njegovo blokiranje moglo biti presudno za buduće tretmane i cijepljenje. Ako možemo razumjeti kako proteini šiljaka rade – što je ono što rade kompjuterske simulacije Folding @ home – onda možemo bolje razviti lijekove koji će ih zaustaviti.
Vrhunac proteina SARS-CoV-2 u akciji. (Preklopni @ home / YouTube)
“Ako biste pokušali simulirati takav proces na svom kućnom računaru, imali biste sreće da vidite čak i dio procesa u narednih 100 godina”, piše Bowman na blogu Folding @ home. 'Srećom, imamo pojačanje!'
Magija Folding @ home je u tome što složene kompjuterske simulacije ponašanja proteina rastavlja na manje zadatke koji se zatim mogu distribuirati na hiljade računara širom svijeta – svaki uzima po komad.
Folding @ home provodi i mnoge druge projekte koji se odnose na koronavirus: obrađuje podatke kako bi se procijenila efikasnost potencijalnih lijekova koji se sada ispituju u laboratorijama i analizira kako koronavirus kontrolira stanični mehanizam nakon infekcije.
